农业工程与食品科学学院具备农业工程一级学科博士学位授权点和食品科学与工程一级学科硕士学位授权点;另外拥有能源与动力(清洁能源技术)和生物与医药(食品工程)两个工程硕士专业学位授权点以及农业管理、食品加工与安全2个专业领域的农业硕士专业学位授权点。